Augalų auginimo substrato dezinfekcija yra svarbi priemonė siekiant apsaugoti būsimus augalus nuo ligų sukėlėjų, kenkėjų ir piktžolių. Priklausomai nuo situacijos ir turimų galimybių, gali būti taikomi skirtingi metodai. Dažniausiai naudojami biologinis, terminis ir cheminis dezinfekcijos būdai.
Biologinis metodas taikomas tuomet, kai užkrėsta dirva išimama iš šiltnamio ar daržinės ir sukraunama į 1–1,5 metro aukščio krūvą. Dirvos sluoksniai permaišomi su šviežiu mėšlu arba palaistomi mėšlo srutomis, kad suaktyvėtų mikrobiologiniai procesai. Jei dirvožemis rūgštus, į vieną kubinį metrą įmaišoma apie 4 kilogramus kalkių, kurios padeda sureguliuoti pH.
Toks dezinfekcijos procesas yra ilgas ir gali trukti dvejus–trejus metus. Per šį laikotarpį dirva bent kartą per metus turi būti perkasta, kad būtų užtikrintas tolygus irimas bei aeracija. Taip pat svarbu reguliariai ravėti, kad krūvoje neįsitvirtintų piktžolės ir neplistų jų sėklos.
Terminis metodas dažniausiai taikomas nedideliam dirvos kiekiui, skirtam daigų auginimui daigyklėse ar vazonėliuose. Dirva paskleidžiama ant geležinio lakšto ar kepimo skardos, prieš tai ją gausiai sudrėkinus. Kaitinimo metu substratas turi būti nuolat maišomas, kad neperkaistų ir neprarastų struktūros.
Kitas terminis būdas – du kartus gausiai užpilti dirvą verdančiu vandeniu. Aukšta temperatūra sunaikina dalį ligų sukėlėjų ir kenkėjų lervų, tačiau svarbu užtikrinti, kad vanduo pasiektų visą apdorojamą sluoksnį. Šis metodas paprastas, tačiau labiau tinkamas mažiems substrato kiekiams.
Cheminis metodas dažniausiai taikomas kovojant su pavojingais dirvos patogenais. Viena iš priemonių – chloro kalkės, kurios veiksmingai naikina daugelį ligų sukėlėjų, įskaitant kopūstų gumbasporę (kilą). Rekomenduojama berti 100–200 gramų chloro kalkių vienam kvadratiniam metrui maždaug 20 centimetrų storio dirvos sluoksnio ir jas įterpti grėbliu.
Svarbu šią dezinfekciją atlikti iš anksto, geriausia rudenį. Jei chloro kalkės naudojamos likus nedaug laiko iki sėjos ar sodinimo, jos gali neigiamai paveikti augalus. Todėl planuojant cheminę dezinfekciją būtina įvertinti laiką ir laikytis rekomenduojamų normų.